外科医生在阴囊处切口，推开阴囊皮肤暴露睾丸并进行摘除
沿龟头冠状沟分离阴茎表皮，并将其推至阴茎底部
将阴茎背神经束(赋予阴茎感觉的神经)、龟头和尿道与阴茎海绵体分离
男性变性手术包括摘除阴茎、睾丸，并塑造阴道、阴唇以及能令患者达到性高潮的阴蒂
在德国一项研究中，所有患者在术后均能达到性高潮
据英国《每日邮报》12月4日报道，欧洲泌尿外科协会近日上传了一个动画视频，视频显示外科医生进行男性变性手术的全过程，包括摘除阴茎、睾丸以及塑造功能完备的女性生殖器。
进行此项手术的患者须达到一定的标准，首先必须由心理专家认定其应当进行变性手术，然后再由外科医生进行检查确保其健康状况良好;除此之外，患者还需有以女性身份生活18个月的经历以及12个月的激素治疗，并通过单边契约合法更名。
视频中，患者躺在手术台上，膝盖弯曲、双脚平放并向外伸展。首先，外科医生将导尿管插入尿道以排尽尿液、收集流体;然后在阴囊处切口，推开阴囊皮肤暴露睾丸并进行摘除;接下来将阴茎背神经束(赋予阴茎感觉的神经)、龟头和尿道与阴茎海绵体分离。下一步，抬高患者双腿，切除阴茎海绵体至耻骨处，仅保留尿道，并将尿道切短，随后按照正常女性尿道的位置将其置于塑造的阴道中，确保正常排尿。然后将多余的阴茎表皮和包皮制成松弛的皮肤管道，随后纳入体内形成阴道。剩余的尿道将缝合入阴道中扩宽其周长，使其术后能以女性身份进行性行为。接下来在一般女性阴蒂和尿道的位置进行切口，并将龟头切至较小尺寸，随后将其精心缝合至切口处形成阴蒂。至于女性外生殖器，阴囊皮肤的每一半进行切割缝合形成大阴唇、小阴唇，医生在手术时会将其放置为阴唇的自然闭合状态。
研究表明，大多数患者在术后对自己的性生活表示满意。德国一所大学进行了24例变性手术，所有患者在术后均能达到性高潮。
英国美容整形外科医生协会的整形外科医生顾问马克?帕奇菲科表示，进行此项手术最重要的是患者的心理问题。由于此项手术不可逆，手术必须由患者和医生具体讨论后才能决定。
